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Présentation Générale

Les activités du LPTC concernent la compréhension des sources, du devenir et de l’impact toxique des polluants organiques dans les différents compartiments de l’environnement (eau, atmosphère, sol). Elles s’articulent autour de plusieurs axes :
- Développements d’outils analytiques (extraction, séparation, identification et quantification) dans le domaine ultra-traces ;
- Etude des distributions, des mécanismes de dispersion, de transport et de transformation des polluants et de la matière organique naturelle ;
- Etude de la réactivité physico-chimique des polluants ;
- Développement de biomarqueurs d’exposition et d’effet toxique (génotoxicité, reprotoxicité) ;
- Modélisation moléculaire et relations structure-activité

Organigramme

Groupe de Physico Toxicochimie de l'environnement

Annuaire des personnels permanents du LPTC

Thématiques de recherches du groupe de Physico Toxico-Chimie de l'environnement

2 thématiques

Modélisation Moléculaire
(GENESTE Nathalie)

Toxicologie environnementale
(CaCHOT Jérome et NARBONNE Jean-François)

Chimie atmosphérique
(VILLENAVE Eric)

Contaminants organiques
(BUDZINSKI Hélène)

Macromolécules Organiques Complexes et Spectroscopie Optique
(PARLANTI Edith)

Equipe contaminants organiques

L’équipe « Contaminants organiques » possède une longue expérience dans le domaine de l’étude des contaminants organiques de l’environnement, et plus particulièrement dans le domaine de l’étude des cycles biogéochimiques des contaminants organiques et dans celui de l’étude de leur impact toxicologique environnemental. Son activité de recherche est focalisée d’une part sur des développements méthodologiques pour l’analyse des polluants chimiques dans l’environnement (développements ultra-traces, multi-résidus, matrices complexes). D’autre part l’équipe étudie les phénomènes biotiques (bioaccumulation, activation métabolique, biodégradation) et abiotiques (photo-oxydation, sédimentation, oxydation thermique et chimique...) qui conditionnent la présence et le devenir des contaminants chimiques organiques dans l’environnement. Elle étudie aussi les mécanismes, qui conditionnent la toxicité des contaminants et a développé de nombreux travaux de recherche dans le domaine de l’étude du transfert vers les organismes, de la bioaccumulation, de la biotransformation des polluants chimiques notamment des HAP et des liens entre exposition et effets toxiques.

L’équipe est équipée des moyens analytiques modernes et sophistiqués indispensables à l’analyse des contaminants organiques à l’état d’ultra-traces (ng/L ou ng/Kg) basés sur la spectrométrie de masse et couplés aux techniques de chromatographie (GC/MS, LC/MS, GC/MS/MS, LC/MS/MS, extracteurs…) ainsi que sur les nombreuses techniques de préparation de l’échantillon solide/liquide et liquide/solide (extracteurs micro-ondes, extracteur sous pression, systèmes SPE, …). L’équipe est aussi dotée des moyens de prélèvement nécessaires en milieu aquatique (vedette, benne à sédiment, bouteilles de prélèvement, …) ainsi que des méthodologies d’échantillonneurs passifs.

L’équipe a une longue expérience de collaboration avec les agences et institutions responsables de la qualité de l’Environnement (Agences de l’eau, IFREMER, CEMAGREF, INERIS) et aussi avec de nombreuses sociétés privées pour développer des approches permettant de caractériser l’impact de leurs rejets et de leur production (TOTAL, Peugeot SA, SUEZ, CEFIC, CONCAWE…)

Equipe Macro molécules organiques complexes et spectroscopie optique.

Les activités de recherche de l’équipe « Macromolécules Organiques Complexes» portent sur l’étude des substances macromoléculaires naturelles/colloïdes, composantes principales de la matière organique dissoute (MOD). Les travaux sont focalisés sur l’étude des cycles biogéochimiques de la MOD dans l’environnement et de son rôle dans le transport, la spéciation et donc la biodisponibilité voire la toxicité des contaminants chimiques.

Le premier volet de cette activité concerne les développements analytiques pour l’analyse physico-chimique de la matière organique macromoléculaire dissoute (MOD) et porte sur la caractérisation et le suivi de ce matériel complexe dans les milieux aquatiques en fonction de son origine et des phénomènes biotiques et abiotiques qui conditionnent sa présence et son devenir.

Le deuxième volet se rattache à l'étude des cycles biogéochimiques des contaminants. Les activités autour de ce thème portent essentiellement sur l'étude des processus d’interactions de la MOD avec les contaminants chimiques et sur le rôle joué par ce matériel organique dans le cycle des substances xénobiotiques dans l’environnement.

L’isolement, la caractérisation et l’étude des propriétés de la matière organique macromoléculaire dissoute constituent encore un challenge tant au niveau national qu’international. L’originalité et la spécificité des travaux de l’équipe sont liées aux milieux aquatiques étudiés : les eaux côtières et marines notamment. Les difficultés analytiques à surmonter qui en découlent sont dues, d’une part, à la grande complexité de ce matériel organique macromoléculaire, et d’autre part, aux très faibles teneurs en matière organique souvent associées à de fortes salinités. Pour cela, un couplage électrodialyse (pour dessaler les eaux) / osmose inverse (pour concentrer la MOD) a été développé.
La caractérisation précise de ce matériel complexe est nécessaire afin d’approfondir le rôle des différentes phases organiques (dissoute, colloïdale, particulaire) sur le transfert des contaminants, sur leur bioaccumulation et sur l’impact toxique vis-à-vis des organismes, en interactions ou pas avec les contaminants. Le développement d’un système de fractionnement par flux/force avec flux asymétrique (en anglais Asymmetric-Flow Field-Flow Fractionation – AF4) offre de nouvelles perspectives dans la caractérisation et la séparation des biopolymères et des macromolécules colloïdales ainsi que dans l’étude des interactions de la MOD avec les contaminants.

L’équipe dispose de techniques très sensibles comme la spectrofluorimétrie tridimensionnelle, technique de choix pour la distinction de masses d’eaux d’origines différentes et la différentiation de ses composants organiques macromoléculaires, présents à l’état de traces, en fonction de leur origine et de leur stade d’évolution. Elle est également bien équipée en techniques séparatives (chromatographie, électrophorèse capillaire, AF4 (Asymmetric-Flow Field-Flow Fractionation), procédés membranaires (ultrafiltration, nanofiltration, osmose inverse)).

Mots-clés : matière organique dissoute (MOD), colloïdes, fluorescence 3D, interaction MOD contaminants, caractérisation, fractionnement, Asymmetric-Flow Field-Flow Fractionation, procédés membranaire

Equipe Toxicologie Environnementale

L’équipe « Toxicologie environnementale » possède une longue expérience dans le domaine de l’étude des effets des polluants organiques sur les organismes aquatiques. Afin de répondre aux besoins de connaissances nouvelles mais également aux exigences réglementaires imposées par REACH et la Directive Cadre sur l’Eau (DCE), notre équipe développe actuellement quatre grands axes de recherche. (1) L’étude des mécanismes d’action et des cibles moléculaires, cellulaires et tissulaires des composés cancérogènes, mutagènes, toxiques pour la reproduction et le développement (CMR). (2) La caractérisation des effets toxicologiques de polluants organiques modèles (HAP, PCB, pesticides) ou en émergence (produits pharmaceutiques) notamment sur les stades précoces de développement. (3) Le développement et/ou l’optimisation de nouveaux bioessais (tests cellulaires et embryo-larvaires) et de biomarqueurs (d’exposition et d’effets) sur les mollusques et les poissons. (4) L’étude des réponses adaptatives biochimiques et physiologiques et des effets écotoxicologiques des organismes aquatiques soumis en milieu naturel à des stress multiples.

Pour réaliser ces études, l’équipe dispose d’un matériel de pointe pour l’analyse des effets de polluants à différents niveaux d’organisation biologique du niveau moléculaire au niveau individuel. Elle dispose notamment d’une animalerie aquatique et d’enceintes thermorégulées pour l’élevage et l’exposition de poissons et mollusques d’eau douce. Elle dispose également d’un accès privilégié au mésocosome aquatique de la société Total à Lacq et aux moyens nautiques du CNRS et de l’Ifremer pour les prélèvements sur le terrain. Par ailleurs le laboratoire est équipé d’un matériel récent pour l’analyse des molécules biologiques (ultracentrifugeuse, spectrophotomètre UV-visible à microplaques, électrophorèse, HPLC) pour la culture cellulaire (Poste de sécurité microbiologique, enceinte de culture à CO2…) et les examens histologiques et morphologiques (microtome, microscopes photonique et à épifluorescence, analyseur d’images).

L’équipe a développé depuis de nombreuses années des liens privilégiés avec des équipes de recherche françaises (Ifremer, Cemagref, CNRS, Universités) et étrangères (Universités du Québec, Université de Géorgie, Universités d’Etats de Caroline du Nord et de l’Iowa), les Agences de l’Eau et des grands groupes impliqués dans le domaine de l’eau (Total, Véolia,…). L’équipe est impliquée dans de nombreux projets de recherche financés au niveau local (Région Aquitaine, Région Haute-Normandie, ….) au niveau national (Agence National de la Recherche, programme PNETOX, EC2CO, Seine-Aval…) et européen (Beep, Biomar, Interreg, Feder).

Mots clés : polluants CMR, poissons, bivalves, stades précoces de développement, génotoxicité, reprotoxicité, embryotoxicité, bioessais, biomarqueurs d’exposition et d’effets, hormones, vitellogénine.

 

Publications récentes les plus représentatives
Aarab N., Davail-Cuisset B., Minier C., Unruh E., Hansen P., Narbonne J.F., Garrigues P. 2006. Plasma sex steroids and vitellogenin levels related to gonad development in immature turbot (Scophtalmus maximus) experimentally exposed to environmental contaminations. Marine Environmental Research, 62 : 265-266

Cachot J., Geffard O., Augagneur S., Lacroix S., Le Menach K., Peluhet L., Couteau J., Denier X., Devier M.H., Pottier D, Budzinski H., 2006. Evidence of genotoxicity related to high PAH content of sediments in the upper part of the Seine estuary (Normandy, France). Aquatic Toxicology, 79 : 257-267.

Cachot J., Law M., Pottier M., Peluhet L., Norris M., Budzinski H., Winn R., 2007. Characterization of toxic effects of sediment associated organic pollutants using the l transgenic medaka. Environmental Science and Technology, 41 : 7830-7836.

Champeau O., Auffret M., Cajaraville M.P., Basseres A., and Narbonne J.F., 2007. Immunological and cytotoxicological responses of the Asian clam, Corbicula fluminea (M.), experimentally exposed to cadmium. Biomarkers, 12 : 173-187

Davail-Cuisset B., Lacomme S., Viaene E., Rouault T., Lepage M., Gonthier P., Williot P., 2008. Hormonal profile in adult European sturgeon, Acipenser sturio, adapted to hatchery conditions in France. Cybium, 33 : 10-12.

Morin B., Narbonne JF., Ribera D., Badouard C., Ravanat JL., 2008. Effect of dietary fat-soluble vitamins A and E and proanthocyanidin-rich extract from grape seeds on oxidative DNA damage in rats. Food Chem. Tox, 46 : 787-796.

Narbonne, J. F., Aarab, N., Clérandeau, C., Daubèze, M., Narbonne, J., Champeau, O. and Garrigues, P., 2005. Scale of classification based on biochemical markers in mussel : application to pollution monitoring in Mediterranean coasts and temporal trends. Biomarkers, 10 : 58-71.

Equipe de Chimie Atmosphérique

L’activité de l’équipe de chimie atmosphérique du LPTC consiste en la recherche d’une meilleure compréhension des mécanismes de formation et de dégradation des polluants dans l’air. Dans cette optique, l’équipe détermine la réactivité des différents radicaux mis en jeu lors de ces processus à travers la détermination de constantes de vitesse et de mécanismes réactionnels pour différents composés organiques volatils ou semi-volatils, associés ou non à des particules. De ces travaux expérimentaux sont déduits des relations structure-réactivité qui permettent d’améliorer sensiblement la qualité des modèles de la chimie de l’atmosphère. L’équipe est actuellement principalement engagée sur deux grands axes :

- L’étude cinétique et mécanistique de réactions radicalaires en phase gazeuse.

Nous avons travaillé essentiellement ces deux dernières années sur 4 sous-thèmes :

1) les réactions du chlore atomique avec une série d’aldéhydes
2) les réactions des radicaux acylperoxyles avec le radical hydroperoxyle
3) les premières étapes de l’oxydation initiée par OH de composés aromatiques
4) les premières étapes de l’oxydation initiée par OH de monoterpènes

- L’étude du devenir de composés organiques persistants associés à des particules primaires et la formation d’aérosols organiques secondaires, issus de l’oxydation atmosphérique de composés organiques volatils.

Nous avons ici aussi travaillé essentiellement sur 4 sous-thèmes :

1) la formation des aérosols organiques secondaires (AOS) issus de l’oxydation des monoterpènes en phase gazeuse
2) les réactions hétérogènes de différents oxydants atmosphériques avec les Hydrocarbures Aromatiques Polycycliques (HAP) adsorbés sur des particules atmosphériques modèles ou réelles
3) la distribution des HAP dans l’atmosphère (sources, répartition)
4) les réactions hétérogènes de différents oxydants atmosphériques avec des retardateurs de flamme particulaires: les PolyBromoDiphénylEthers (PBDE)

Le point fort de nos activités repose sur l’originalité de notre travail, que ce soit en chimie homogène ou hétérogène. Les approches cinétiques, analytiques, théoriques et toxicologiques que nous réunissons autour de cette thématique sont pour l’instant tout à fait uniques car pluridisciplinaires et présentes en un même lieu géographique. Ces points forts sont notamment récompensés par une reconnaissance se traduisant notamment par la participation au Réseau d’Excellence européen ACCENT (6° PCRD), à un programme de l’ESF (INTROP), à divers Comités Scientifiques..., des invitations dans des congrès internationaux et par un auto-financement total de notre recherche (ANR, Programmes LEFE-ChAt de l’INSU, Programmes PRIMEQUAL du MEDAD…)

liens utiles: Atmospheric Soot Network

Equipe Modélisation Moléculaire

Les travaux de l’équipe « Modélisation Moléculaire » appartiennent aux deux grands axes de recherches du groupe LPTC, à savoir « Physico-Chimie de l’Environnement » et « Biochimie et Toxicologie ». L’activité de l’équipe « Modélisation Moléculaire » au sein du LPTC est une activité transversale.

Nos thèmes de recherche s’articulent autour de deux axes principaux situés à l'interface de la Chimie et de la Biologie, à savoir :

1) Les Sciences de l’Environnement dont les objectifs sont :
- Prédiction de la stabilité et du devenir de contaminants présents dans l’environnement.
- Elaboration de relations de type Structure-Activité (SARs et QSARs).
- Etude des interactions xénobiotiques/récepteurs biologiques.
           
2) La Chimie Thérapeutique :
- Conception assistée par ordinateur de nouvelles molécules actives basée sur la structure du récepteur (Structure Based Drug Design) et/ou sur les ligands (Pharmacophore Based Drug Design).

Dans le thème Sciences de l’Environnement, nous travaillons sur la prédiction de la stabilité et du devenir de contaminants présents dans l’environnement en l’appliquant sur les Hydrocarbures Aromatiques Polycycliques (HAP), comme par exemple les dérivés du rétène.
Une soixantaine de dérivés et de précurseurs du rétène ont fait l’objet d’une étude structurale, de stabilité (calcul de propriétés thermodynamiques) et d’une étude de solubilité (logP, Ks) en AM1/RHF. D’autre part, les chemins réactionnels possibles lors des processus de déshydrogénation, de déméthylation et de décarboxylation ont été analysés afin de prédire la séquence la plus probable de dégradation de l’acide abiétique en rétène.

L’étude des interactions xénobiotiques/récepteurs biologiques et l’élaboration de relations de type Structure-Activité (SARs et QSARs) a été appliquée, entre autre, aux perturbateurs endocriniens (PE).
Disposant de la structure 3D de ligands œstrogéniques et anti-œstrogéniques co-cristallisés avec le récepteur œstrogénique a humain (hERa), il est possible d’étudier et d’élaborer des relations entre la structure des xéniobiotiques et l’effet observé (œstrogénique ou anti-œstrogénique) pour des PE potentiels. Par ailleurs, l’utilisation conjointe des outils de modélisation par homologie de séquences, d’amarrage moléculaire (docking) et de dynamique moléculaire ont permis de construire les récepteurs biologiques dont la structure 3D n’a pas été résolue expérimentalement afin de pouvoir prédire l’affinité des perturbateurs endocriniens potentiels.
           
Cette approche a également été appliquée aux insecticides néonicotinoïdes (fipronil, imidaclopride) et à leurs métabolites afin de mieux comprendre leurs interactions et leurs implications vis-à-vis des récepteurs cholinergiques nicotiniques post-synaptiques (nAChR) de l’abeille Apis mellifera et de l’Homme.

En Chimie Thérapeutique, en collaboration avec l’équipe de S. Quideau du groupe « Synthèse et molécules bioactives » de l’ISM, nous recherchons à modifier in silico la structure de peptides antigéniques sous la forme de peptidomimes afin d’accroître leur immunogénécité et leur biostabilité vis-à-vis de complexe TCR/CMH de classe I.
Les recherches actuelles ont permis de concevoir (in silico + synthèse) un candidat ayant une forte affinité pour la molécule d’HLA-A2 et stimulant de manière efficace plusieurs clones spécifiques à Melan-A. Cette molécule constitue un candidat attractif pour de futures modifications et dans le développement d’un vaccin anti-mélanome.

Mots-clés : docking, dynamique moléculaire, chimie théorique, contaminants, drug design, QSAR, PE

Plateforme et instruments

Chimie atmosphérique, cinétique et réactivité.
(resp : E. Villenave ; e.villenave@ism.u-bordeaux1.fr)
1 réacteur à photolyse éclair (lampes à Argon) couplé à une détection par spectrométrie d’absorption UV (Deutérium) (Réactions des radicaux Cl, Br, des radicaux RO2…)
1 réacteur à photolyse laser (laser à Excimères) couplé à une détection par spectrométrie d’absorption UV (Xénon et Deutérium) (Réactions du radical OH, des radicaux RO2…)
2 réacteurs quasi-statiques à ozonolyse, avec détection par spectrométrie d’absorption UV (Deutérium et Mercure)
1 réacteur à écoulement rapide – décharge micro-onde – couplé à une détection radicalaire par fluorescence induite par laser (Réactions du radical OH, des NOx,…)
1 rampe à vide – mélange de gaz
1 spectromètre IRTF BIORAD
1 spectromètre de masse quadripolaire mobile BALZER (S. Lazare)
2 lasers à excimères LAMBDA PHYSIC
1 laser Nd-YAG QUANTEL
1 laser à colorant QUANTEL

Chimie analytique séparative et spectrométrie de masse.
(resp. H. Budzinski ; h.budzinski@ism.u-bordeaux1.fr)
Couplage chromatographie en phase liquide / spectrométrie de masse en tandem triple quadrupôle (UPLC/MS/MS et RPLC/MS/MS) (Waters et Agilent Technologies)
Couplage chromatographie en phase liquide / spectrométrie de masse quadripolaire (LC/MS) (Agilent Technologies)
Couplage chromatographie en phase gazeuse / spectrométrie de masse temps de vol haute résolution (GC/TOF) (Waters)
Couplage chromatographie en phase gazeuse / spectrométrie de masse isotopique (GC/IRMS) (Thermo)
Couplage chromatographie en phase gazeuse / spectrométrie de masse en tandem triple quadrupôle (GC/MS/MS) (Waters)
Couplages chromatographie en phase gazeuse / spectrométrie de masse (GC/MS) (Agilent Technologies) (injecteurs PTV, Splitless, SPME, Headspace)
Chaînes de chromatographie en phase liquide haute performance (HPLC) (Agilent Technologies et Thermo)

Chimie analytique séparative et spectroscopies UV et de fluorescence.
(resp. E. Parlanti ; e.parlanti@ism.u-bordeaux1.fr)
Système de fractionnement par flux/force avec flux asymétrique (Asymmetric-Flow Field-Flow Fractionation – AF4) avec détection par diffusion de lumière statique multi angulaire (MALLS) et diffusion dynamique de la lumière (DLS). WYATT TECHNOLOGY
Système ELIX100/Milli-Q MILLIPORE
Analyseur TOC Shimadzu V CSN
Electrophorèse capillaire Beckman
Chaînes HPLC (détecteur UV-DAD, Fluo) (Agilent Technologies, Amersham)
Pilote osmose inverse TIA
Colonnes d’extraction
Unités d’ultrafiltration MILLIPORE et AMICON
Spectrofluorimètre FL3-22 SPEX JOBIN YVON
Spectrofluorimètre F4500 HITACHI
Spectrophotomètre JASCO

Chimie analytique préparation de l’échantillon.
(resp. H. Budzinski ; h.budzinski@ism.u-bordeaux1.fr)
Extracteurs micro-ondes à pression atmosphérique et sous pression) (Prolabo et Thermo)
Extracteur ASE (sous pression) (Dionex)
Matériel de préparation de l’échantillon : lyophilisateur, broyeurs, centrifugeuse réfrigérée…
Matériel d’extraction en phase solide pour les échantillons aqueux (SPE et SPME)
Evaporateurs Speedvap et Rapidvap
Ultracentrifugeuse
Congélateurs – 80°C
Matériel de prélèvement de terrain, véhicule mission et embarcation nautique motorisée
Balance micro-analytique

Biochimie.
(resp. J.F. Narbonne ; jf.narbonne@ism.u-bordeaux1.fr)
Lecteurs de microplaque
Autoclave
Fluorimètre
Spectrophotomètres
Salle de culture cellulaire
Microscope à épifluorescence + logiciel d’acquisition d’image avec caméra
Congélateur -80°C
Chambre froide
Local et matériel de stabulation et expérimentation organismes aquatiques
Cryo-conservateurs

Modélisation Moléculaire.
(resp. N. Geneste ; n.geneste@ism.u-bordeaux1.fr)
3 stations de travail SGI
3 PC sous Linux
5 PC sous Windows
Logiciels : InsightII, Cerius² (QSAR+, LigandFit, Ludi), Macromodel, Hyperchem, Catalyst, Statistica

Enseignements

Licence ST Chimie, parcours Chimie du Vivant et de l’Environnement.

Après une vaste réflexion menée à l’occasion de la mise en place du LMD dans le cadre du contrat quadriennal 2003-2006 afin de réformer l’enseignement de chimie à l’Université Bordeaux 1, une nouvelle formation en Chimie du Vivant et de l’Environnement a été mise en place. Le parcours « Chimie du Vivant et de l’Environnement » de la Licence Sciences et Technologies (ST) mention Chimie a été crée en Septembre 2002 comme parcours pilote (passage de l’Université Bordeaux 1 au LMD en septembre 2003).
      La formation proposée se situe à l'interface Chimie-Biologie-Environnement, et s'articule autour d'une formation solide dans le domaine des sciences chimiques, selon une division de l'enseignement en tronc commun et options. Cette division de l'enseignement assurera à l'étudiant le niveau de connaissance de la chimie moderne nécessaire à la réalisation de son projet professionnel. Le tronc commun repose sur un enseignement à parts égales des quatre disciplines principales des sciences chimiques : chimie-physique, chimie organique, chimie inorganique et chimie analytique. Les deux options proposées pour cette filière ont pour thématique ; d'une part la Chimie Bio-organique en relation avec les applications thérapeutiques des molécules organiques et inorganiques, et d'autre part la Chimie de l’environnement, en relation avec les sciences de l'environnement en général, la biogéochimie, la toxico-chimie environnementale et les techniques d’échantillonnage en particulier.

Site Licence Chimie

Master ST Chimie, spécialité Qualité - Chimie de l’Environnement (QUALENC).

Le Master, mention chimie est une formation Bac +5 qui a pour objectif de former des étudiants de très bon niveau scientifique. Pour favoriser l’insertion professionnelle, le Master est adossé aux laboratoires de chimie de Bordeaux 1, reconnus pour leur excellence en recherche et des entreprises françaises (PME/PMI, Total, Sanofi). La structuration en spécialités reflète ainsi les forces de Bordeaux 1 dans la chimie moléculaire et supramoléculaire, la chimie de l'environnement, la chimie théorique, les polymères et les milieux dispersés, ainsi que la chimie des matériaux. Chacune de ses dernières permet à l’étudiant de se spécialiser dans un domaine de la chimie selon son projet professionnel. Ce Master, conforme aux exigences de l'Espace Européen de l'Enseignement Supérieur, est organisé en différents parcours. Chacun d’entre eux propose un choix d'options en accord avec la spécialité choisie par l’étudiant. Enfin, le Master Chimie offre aux étudiants la possibilité de compléter leur formation à l’étranger grâce à des échanges avec les principales universités européennes.
      La formation QUALENC conjugue les sciences chimiques, la qualité dans le monde de l’entreprise et les sciences de l'environnement, en s'appuyant particulièrement sur une formation solide dans le domaine des sciences chimiques analytiques. La formation offerte est bi-disciplinaire dans le domaine du Management Qualité et de la Chimie de l’Environnement avec spécialisation dans l’un des deux secteurs. Cette spécialité, à la fois recherche et professionnelle, présente un caractère fortement pluridisciplinaire. Le parcours recherche sera plus particulièrement orienté vers la chimie environnementale (caractérisation, devenir et impact toxique des polluants chimiques dans les différents compartiments environnementaux). L’objectif principal du parcours professionnel sera de former des cadres capables notamment de mettre en place, gérer et faire évoluer les systèmes "Qualité – Sécurité – Environnement" d'une entreprise.

Site Master Chimie

Diaporama disponible

Plaquette Qualenc

Equipe Toxicologie Biochimique

Application et validation de biomarqueurs d’expositions mesurés sur des organismes aquatiques.

Développement et perfectionnement de l’échelle indiciaire multimarqueurs, outil permettant d’intégrer la masse de données biomarqueurs générée lors de programmes de biomonitoring (études in situ).
Développement au niveau fondamental de biomarqueurs d’effets cytotoxiques, génotoxiques et reprotoxiques sur des organismes aquatiques.
Application des biomarqueurs d’effets, pour évaluer la réponse d’organismes exposés à des produits purs ou en mélange en aquarium et en mésocosmes (rivières pilotes en eau douce, milieu semi-ouvert à flux continu en eau de mer).
Développement de techniques de détection et de dosage d’hormones impliquées dans le cycle de reproduction des poissons, et sensibles (soumises) aux perturbations endocriniennes.
Application et développement de bioessais DR et ER-Calux®

Offres de thèses

"Novel Experimental Approaches in the Understanding of Aromatic Compound Degradation in the Atmosphere.”

"Conception rationnelle de nouveaux peptidomimes dans le développement d’un vaccin anti-mélanome."

 

Thèses en cours

CAPDEVILLE Marion-Justine
"Etudes des cycles biogéochimiques des contaminants organiques dits émergents en milieu aquatique."
OCT 06

DANIAL-FORTIN Pierre
"Etude de la réactivité des résidus pétroliers dans les conditions d’hydroconversion."
NOV 06

MURCIA Frédéric
"Etude de la contamination du bassin d'Arcachon par les pesticides."
OCT 07

VICQUELIN Ludovic
"Effets embryotoxiques de HAP sédimentaire chez le Medaka."
OCT 07

GROSSIN DEBATTISTA Julien
"Etudes des fractionnements isotopiques engendrés par la méthanogénèse : Apport pour la compréhension des processus de biodégradation et pour l’évaluation des impacts des installations de stockage de déchets."
NOV 07

ABOU MRAD Ninette
"Cycle de la contamination du littoral Libanais par les HAP."
FEV 08

GUILLON Amélie
"Etude de la composition isotopique moléculaire comme traceur de source qualitatif et quantitatif des HAP particulaires dans l’Atmosphère."
SEPT 08

BARJHOUX Iris
"Etude de la toxicité et de la biodisponibilité de bubstances chimiques à risque dans les sédiments de la Région Aquitaine."
OCT 08

CREUSOT Nicolas
"Caractérisation de la contamination du milieu aquatique par les perturbateurs endocriniens par une approche combinant tests biologiques « in vitro » et méthodes physico-chimiques."
OCT 08

RINGUET Joany
"Caractérisation des dérivés du Benzo[a]Pyrène (B[a]P) en atmosphère réelle et en laboratoire."
OCT 08

AZOURY Sabine
"Contamination des compartiments biologiques et géochimiques du littoral Libanais et Français par des HAP : niveaux – empreintes – distribution et quantification des sources."
DEC 08

SOULIER Coralie
"Développement des capteurs passifs pour les contaminants des systèmes aquatiques."
JANV 09

KOUZAYHA Abir
"Implémentation des capteurs passifs POCIS (Polar Organic Chemical Integrative Sampler) ou SBSE (Stir Bar Sorption Extraction) lors de l’étude de l’extraction des contaminants organiques dans les milieux cotiers."
JANV 09

KANAN Rami
"Etude des phénomènes de bioaccumulation et de biotransformation des polluants organique d’intérêt pour l’environnement aquatique : HAP, pesticides."
MARS 09

BELLES Angel
"Developpement de capteurs passifs pour la détection de micro-polluants organiques dans l'eau"
OCT 2009

Offres de Stages

Stages de Master Sciences et Techniques mention Chimie:

"Étude expérimentale du rôle des aldéhydes dans la formation des pics d’ozone troposphérique"

"Étude cinétique et isotopique de la photoxydation du Hg atmosphérique"

Démarche Qualité

Dans un contexte de compétitivité croissante vis-à-vis des financeurs et des décideurs nationaux, européens et internationaux, les laboratoires de recherche français tendent à améliorer la maîtrise de leurs processus de recherche afin de gagner en lisibilité, réactivité, efficacité, fiabilité des résultats générés et reconnaissance scientifique. La mise en place d’une démarche qualité peut permettre de répondre à de tels enjeux. Cependant, les activités scientifiques en laboratoire rassemblent de nombreux acteurs et s’étendent sur des domaines d’application complexes et variés ayant chacun leurs propres spécificités. De plus la conduite d’un projet de recherche fondamental ou appliqué passe par plusieurs étapes (développements théoriques, expérimentations, observations critiques, modélisations…) pouvant générer de nombreux facteurs de « non qualité » comme par exemple, l’obtention de résultats inattendus, non explicables voir inexploitables. Partant de ces constats, il peut s’avérer difficile d’envisager la mise en place d’une démarche qualité sous forme de méthodes normatives pouvant paraître trop contraignantes et restrictives. L’approche qualité ne doit pas être perçue comme un frein à la créativité et liberté des chercheurs, elle doit permettre néanmoins de répondre à des notions essentielles visant l’amélioration de chaque activité de recherche : bonnes pratiques scientifiques, traçabilité des travaux, pérennité du savoir-faire, transparence, validation, valorisation et communication des résultats, optimisation des moyens humains, techniques et financiers…

 Les attentes de la mise en place d’une démarche qualité au sein du LPTC sont motivées par l’amélioration des modes de fonctionnements en interne : mieux travailler, mieux structurer, apporter plus de rigueur, plus de vigilance, de confiance dans les modes de travail et augmenter la fiabilité et la validité des résultats générés. Cette démarche vise également à améliorer la satisfaction des partenaires scientifiques externes (collaborateurs, financeurs et décideurs) pour leurs permettre d’avoir plus de lisibilité des processus de recherche du laboratoire et de crédibilité des résultats scientifiques. Dans ce but, le LPTC a initié depuis quelques années déjà, la mise en place de bonnes pratiques au laboratoire tant sur le plan scientifique qu’organisationnel. Afin de structurer cette démarche, de l’améliorer et d’obtenir un label qualité, le laboratoire vise la certification ISO 9001 (vs 2008 ) .

 

Initiation d’une démarche qualité au sein du LPTC

La démarche qualité a été initiée au LPTC fin 2004, ce dernier comporte actuellement cinq équipes thématiques de recherche et une cellule de transfert technologique. Certaines activités sont géographiquement délocalisées, c’est pourquoi, afin de mieux maîtriser la mise en place de la démarche qualité, il a été décidé dans un premier temps, de limiter cette dernière au « plateau chimie ». Les autres équipes de recherche du LPTC, ne faisant pas partie du périmètre défini pour la mise en place du Système de Management Qualité (SMQ), seront gérées comme des interfaces à ce dernier. La démarche qualité est animée par le Responsable Management Qualité (RMQ), les réflexions sont discutés et initiées par la cellule Qualité et l’ensemble du personnel contribue aux actions qui en découlent.

 

Principales actions qualités engagées au LPTC

Mise en place de cahiers de laboratoire numérotés contrôlés et tracés : ces derniers garantissent la traçabilité des études effectuées et facilitent la transmission et le partage du savoir faire : pérennité des travaux de recherche sur plusieurs années.

Mise en place d’une procédure d’accueil des nouveaux entrants: accueil des nouveaux entrants avec visite des locaux, présentation du personnel, des activités scientifiques et satisfaction des obligations administratives.

Rédaction des chartes de bonnes pratiques au laboratoire pour les groupes de recherche appartenant au périmètre de la démarche qualité du laboratoire : ces documents énoncent les règles de bonnes pratiques au laboratoire et de fonctionnement de chaque équipe.

Elaboration de la pyramide documentaire attenante au système qualité: rédaction de procédures, modes opératoires et enregistrements nous permettant de formaliser nos méthodes de travail, nos protocoles analytiques, nos contrôles de performances notre organisation et notre structure.

Restructuration et organisation des espaces de travail: cette action est une application directe de la démarche 5S et de l’analyse des modes de défaillance :  éliminer, ranger, nettoyer, inspecter, standardiser, respecter et faire respecter les standards, gagner en efficacité de travail, optimiser et sécuriser les postes de travail.

Mise en place de cahiers de vie et d’utilisation des instruments scientifiques: cette action permet d’assurer la traçabilité des différents outils scientifiques, d’en contrôler l’efficacité et les performances et de garantir les résultats générés : métrologie, carte de contrôle par exemple.

Gestion des composés standards analytiques : classement et suivi des stocks des composés standards. Mise en place de banques de données accessibles à l’ensemble des utilisateurs comportant : descriptif des produits, numéro de lot, fiches sécurité MSDS, suivi des utilisations…

Gestion des échantillons: classement et archivage des échantillons arrivant au laboratoire. Mise en place de banques de données accessibles à l’ensemble des manipulateurs, organisation du stockage des échantillons, traçabilté et suivi de l’échantillon au cours des différents processus d’analyses (filtration, lyophilisation, broyage, extraction, purification, analyse…)

Partenariat

Universitaire local:

Université de Pau (IPREM), UMR EPOC, Institut Européen de Chimie et Biologie (IECB),...

Universitaire international:

Japon, Allemagne, République Thèque, Grèce, Maroc, Tunisie, Espagne, Italie, Portugal, Brésil, Hollande, Suède, USA, Canada, ……

Industriel et institutionnel régional:

SIBA, Compagnies des eaux, AIRAQ, Institut Européen de l’Environnement de Bordeaux (IEEB), Conseil Régional d'Aquitaine, Conseil Général de la Dordogne, Chambre Régionale d'Agriculture, Communauté Urbaine de Bordeaux,

Industriel national et international:

TOTAL, CEFIC, Peugeot, EDF, IFP, Ford, Danone, Petrobras, …

Institutionel hors université:

IFREMER, CEMAGREF, INRA, INERIS, Agences de Bassin, CEDRE, …

Projets Européens et ANR

SWIFT
(Screening method for water data information in support of the implementation of the water framework directive)

Feeding Fat Safety Project

INTROP
European Network (Interdisciplinary Tropospheric Research : from the Laboratory to Global Change)

ACCENT
Réseau d’Excellence Européen NoE (Atmospheric Composition Change)

ASN
Réseau international (Atmospheric Soot Network) (Co-fondateur)

 

ANR

POPSTART
Etude de l’oxydation de polluants organiques associés aux particules atmosphériques : développements analytiques, réactivité et toxicité

AMPERE
Analyse de Micropolluants Prioritaires et Emergents dans les Rejets et les Eaux Superficielles

DIPERPHA
Dynamique et Impact des Perturbateurs endocriniens et des composés Pharmaceutiques issus des élevages agricoles.

SOLE-BEMOL
Devenir et effet des contaminants dans les soles : réponse biologique à l’échelle de l’individu et de la population

Eel-Scope
Ecotoxicological and Economical Liability of eel exposed to Seasonal and global Change-induced O2-depletion and Pollution in Estuaries

EMESTOX
Echantillonneurs passifs pour la MEsure des Substances chimiques et de la TOXicité associée dans l’eau et les effluents industriels